42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1870 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  100 
 
 		 503 aa  996    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  66.26 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  66.26 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  32.1 
 
 		 508 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  31.93 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.33 
 
 		 463 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  28.71 
 
 		 479 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  28.3 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  28.3 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  28 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  28.38 
 
 		 474 aa  104  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.68 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  25.65 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  26.13 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  22.57 
 
 		 381 aa  61.6  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  23.62 
 
 		 297 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  24.77 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  24.54 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  24.54 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  24.54 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  24.54 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  24.54 
 
 		 385 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.51 
 
 		 311 aa  52  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  22.35 
 
 		 377 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.24 
 
 		 329 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.57 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  21.96 
 
 		 402 aa  47.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.34 
 
 		 321 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  30.15 
 
 		 345 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.9 
 
 		 351 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.94 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.36 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5040  phage integrase  24.26 
 
 		 732 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.346055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5516  phage integrase  25.47 
 
 		 734 aa  45.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0248661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  25.12 
 
 		 308 aa  45.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.06 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>