78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3164 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 
479 aa  961    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  61.44 
 
 
508 aa  581  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  55.65 
 
 
472 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  44.81 
 
 
479 aa  355  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  46.08 
 
 
464 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  46.08 
 
 
464 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  46.06 
 
 
438 aa  350  3e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  44.69 
 
 
463 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  32.95 
 
 
474 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  30.86 
 
 
397 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
484 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.78 
 
 
495 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.78 
 
 
495 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  32.49 
 
 
521 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  31.19 
 
 
503 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  32.96 
 
 
437 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  22.66 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  24 
 
 
372 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  22.84 
 
 
315 aa  53.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.08 
 
 
305 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.15 
 
 
295 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.93 
 
 
307 aa  50.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 
313 aa  50.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  36.14 
 
 
253 aa  48.9  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  23.78 
 
 
270 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  21.86 
 
 
308 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  31.85 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  19.59 
 
 
307 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  27.78 
 
 
310 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  27.27 
 
 
310 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  33.05 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  36.14 
 
 
256 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  33.05 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 
303 aa  47.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2016  phage integrase family protein  28.47 
 
 
333 aa  47.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  25.14 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  25.14 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  25.14 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  25.14 
 
 
410 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  25.14 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  25.14 
 
 
385 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  24.74 
 
 
311 aa  47  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6209  Phage integrase  34.15 
 
 
303 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  27.19 
 
 
294 aa  47  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 
321 aa  47  0.0009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  31.36 
 
 
302 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  26.79 
 
 
299 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  20.69 
 
 
379 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.21 
 
 
302 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 
324 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.63 
 
 
310 aa  45.8  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  34.74 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  34.74 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1733  integrase family protein  27.33 
 
 
333 aa  45.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.45 
 
 
314 aa  45.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  20.97 
 
 
328 aa  45.1  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 
321 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.62 
 
 
290 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0221  phage integrase  25.19 
 
 
349 aa  44.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.118358  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  31.45 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 
317 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 
331 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  31.45 
 
 
364 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.63 
 
 
311 aa  44.3  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  30 
 
 
373 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  36.9 
 
 
315 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 
299 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.51 
 
 
298 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.69 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.37 
 
 
339 aa  43.5  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.69 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 
311 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.02 
 
 
299 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.69 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
303 aa  43.5  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
303 aa  43.5  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.51 
 
 
299 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  22.86 
 
 
295 aa  43.5  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>