209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4229 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  100 
 
 		 479 aa  961    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  64.61 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  64.61 
 
 		 464 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  62.28 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  63.66 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  44.81 
 
 		 479 aa  355  8.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  44.51 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  45.31 
 
 		 472 aa  307  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  32.3 
 
 		 474 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  30.11 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 495 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  29.31 
 
 		 495 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  27.5 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  28.24 
 
 		 503 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  28.36 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  21.74 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.87 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 377 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 377 aa  57  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  26.03 
 
 		 311 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  23.33 
 
 		 303 aa  53.5  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.36 
 
 		 305 aa  53.5  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  24.31 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  23.51 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  23.51 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  20.72 
 
 		 307 aa  51.6  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  21.59 
 
 		 302 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  31.36 
 
 		 300 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 310 aa  51.2  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  36.52 
 
 		 320 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  26.34 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3374  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 328 aa  50.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  26.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  26.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  26.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  26.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  26.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0052  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 329 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.578512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  35.71 
 
 		 367 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0928  integrase family protein  37.37 
 
 		 326 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.669409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  34.78 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  20.24 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  28.87 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.73 
 
 		 300 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  30.26 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  29.36 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  18.7 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.61 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  25.99 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  21.2 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.2 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 		 303 aa  48.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4375  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  27.74 
 
 		 324 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  23.26 
 
 		 303 aa  48.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  30.51 
 
 		 306 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  27.46 
 
 		 302 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0563  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.58 
 
 		 306 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.792208  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  31.88 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2215  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.58 
 
 		 306 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3697  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.7 
 
 		 328 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 330 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  25.85 
 
 		 294 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.21 
 
 		 323 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 322 aa  47.4  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.9 
 
 		 310 aa  47  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.63 
 
 		 324 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  33.93 
 
 		 365 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  24.08 
 
 		 331 aa  46.6  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1177  integrase family protein  32.32 
 
 		 329 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.11 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  27.38 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  33.93 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.76 
 
 		 339 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  22.28 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6209  Phage integrase  28.74 
 
 		 303 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.47 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  34.52 
 
 		 253 aa  46.2  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  28.67 
 
 		 307 aa  46.6  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  24.32 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.9 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 322 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  32.14 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3133  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.11 
 
 		 315 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  36.99 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2996  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 306 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0170  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.14 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>