More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7706 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  100 
 
 		 385 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  100 
 
 		 385 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  100 
 
 		 410 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  100 
 
 		 385 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  100 
 
 		 385 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  100 
 
 		 385 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  36.41 
 
 		 381 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6209  Phage integrase  34.38 
 
 		 303 aa  156  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  29.97 
 
 		 379 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  28.32 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  28.79 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  27.6 
 
 		 392 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6755  integrase family protein  27.13 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  26.41 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  25.65 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  25.07 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  28.3 
 
 		 295 aa  67  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  22.31 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  27.3 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  25.94 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  25.94 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  27.19 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.59 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.3 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.2 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  29.97 
 
 		 297 aa  63.5  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.7 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  23.9 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.77 
 
 		 295 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.21 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  30.49 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.59 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  35.09 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  32.16 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.31 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  30.84 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  26.99 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  30.84 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2861  phage integrase family protein  30.17 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2699  integrase family protein  26.69 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  32.09 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.34 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  25.15 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.2 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  27.7 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3696  integrase domain protein SAM domain protein  23.96 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.851802  normal  0.785312 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  25.13 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  22.46 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.72 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.85 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.96 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  30.51 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  26.16 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  26.76 
 
 		 317 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  29.5 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  28.24 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  29.24 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  27.23 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.99 
 
 		 305 aa  55.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  29.29 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  24.83 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 290 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2742  phage integrase family site specific recombinase  22.02 
 
 		 269 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0873278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  23.64 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.05 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  30.48 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  30.99 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.65 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0372  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  23.81 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.23 
 
 		 307 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  26.55 
 
 		 438 aa  53.9  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.65 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  30.37 
 
 		 254 aa  53.9  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>