More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7364 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  100 
 
 		 397 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  31.58 
 
 		 508 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 479 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  32.21 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  29.55 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  29.55 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  29.72 
 
 		 438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.02 
 
 		 463 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  26.82 
 
 		 479 aa  126  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 484 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  24.94 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  27.22 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  28.79 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  28.79 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  28.79 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  28.79 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  28.79 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  28.79 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  26 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  23.93 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  26.13 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  28.61 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  28.61 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  26.1 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  26.69 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  26.4 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  23.93 
 
 		 302 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  25.74 
 
 		 411 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  24.29 
 
 		 302 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.72 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  27 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  24.86 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.54 
 
 		 277 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  25.71 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  26.47 
 
 		 295 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  24.86 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  22.22 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6755  integrase family protein  24.19 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  25.82 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  25.79 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  22.02 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  25.57 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.29 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  26.14 
 
 		 303 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  23.68 
 
 		 298 aa  65.9  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  25.22 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  25.44 
 
 		 309 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  31.69 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.21 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  23.92 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  24.38 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  24.92 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  22.87 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.3 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.57 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  26.04 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  22.48 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  24.64 
 
 		 300 aa  62  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  24.78 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.93 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.92 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  26.6 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  23.58 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.49 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  24.71 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  25.29 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  24.84 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  24.35 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2731  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  24.48 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.85 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25.51 
 
 		 296 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>