More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0986 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  100 
 
 
384 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  57.22 
 
 
372 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  44.88 
 
 
370 aa  335  7e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  53.95 
 
 
519 aa  326  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  35.47 
 
 
361 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  32.97 
 
 
395 aa  216  5e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  36.6 
 
 
361 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  34.67 
 
 
373 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  32.39 
 
 
364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  32.39 
 
 
364 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  32.74 
 
 
344 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  33.23 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.67 
 
 
367 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  30.86 
 
 
323 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  23.33 
 
 
401 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  24.23 
 
 
399 aa  113  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  24.23 
 
 
399 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  24.23 
 
 
399 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  23.98 
 
 
388 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  23.98 
 
 
388 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  23.98 
 
 
388 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  25.14 
 
 
393 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  23.34 
 
 
393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  23.34 
 
 
393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  23.34 
 
 
393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  23.34 
 
 
393 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  26.36 
 
 
385 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.16 
 
 
295 aa  86.3  9e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  21.65 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  22 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  20.86 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  20.86 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  20.86 
 
 
349 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  21.45 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  23.45 
 
 
381 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  21.26 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2147  phage integrase  20.75 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3532  phage integrase  20.75 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.346968  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  21.1 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  21.1 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  21.1 
 
 
324 aa  72.4  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  27.08 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3611  integrase domain protein SAM domain protein  19.21 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00442535  normal  0.0137307 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  24.01 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.67 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.76 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  29.61 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  25.09 
 
 
307 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  27.55 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  24.71 
 
 
304 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.88 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  25.4 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  30.34 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  30.34 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  22.22 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  30.34 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.98 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  22.99 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  24.19 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  24.21 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  24.15 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  20.4 
 
 
341 aa  67  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.68 
 
 
305 aa  67  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  22.29 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  29.66 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.43 
 
 
318 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.61 
 
 
311 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  21.96 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.29 
 
 
314 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.61 
 
 
295 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  24.28 
 
 
313 aa  65.5  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  20.6 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  20.6 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  29.59 
 
 
390 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  23.19 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1126  phage integrase family protein  23.28 
 
 
396 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  21.01 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  30.19 
 
 
339 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.81 
 
 
302 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  20.6 
 
 
334 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2844  integrase family protein  22.13 
 
 
329 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  20.46 
 
 
299 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  31.82 
 
 
141 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  22.95 
 
 
294 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 
295 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  23.81 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>