25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2255 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 
484 aa  995    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  34.15 
 
 
521 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  33.72 
 
 
474 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  33.8 
 
 
437 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  32.95 
 
 
508 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.82 
 
 
479 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  31.36 
 
 
464 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  31.36 
 
 
464 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  31.96 
 
 
472 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  31.95 
 
 
438 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  31.85 
 
 
479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.96 
 
 
463 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  25.77 
 
 
397 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  26.68 
 
 
503 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
495 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4884  hypothetical protein  37.17 
 
 
161 aa  65.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  24.88 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21 
 
 
295 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  28.04 
 
 
373 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  30.56 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  30.56 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.41 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  37.66 
 
 
304 aa  45.1  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  28.57 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>