16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2813 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  80.55 
 
 
437 aa  723    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1048    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.15 
 
 
484 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4884  hypothetical protein  55.26 
 
 
161 aa  170  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  30.38 
 
 
474 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.49 
 
 
479 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  31.21 
 
 
508 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  29.79 
 
 
464 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  29.79 
 
 
464 aa  141  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
463 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  30.11 
 
 
479 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  29.69 
 
 
438 aa  134  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  30.11 
 
 
472 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  26.1 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.46 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.46 
 
 
495 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>