33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4144 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  100 
 
 		 508 aa  1026    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  61.65 
 
 		 479 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  53.18 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  45.41 
 
 		 464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  45.41 
 
 		 464 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  45.68 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  44.51 
 
 		 479 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  47.03 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  33.41 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  33.41 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  31.58 
 
 		 397 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.69 
 
 		 495 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  31.91 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  32.3 
 
 		 503 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  31.73 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  22.94 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  20.72 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  20.72 
 
 		 377 aa  50.1  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  37.04 
 
 		 303 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  22.86 
 
 		 372 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  26.04 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  26.04 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  26.04 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  26.04 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  26.04 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  26.04 
 
 		 385 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  34.83 
 
 		 253 aa  44.3  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 300 aa  44.3  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  29.92 
 
 		 311 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  32.1 
 
 		 310 aa  43.9  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 307 aa  43.9  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  23.49 
 
 		 307 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>