291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3037 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  884    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  933    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 464 aa  933    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  64.61 
 
 		 479 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  63.94 
 
 		 463 aa  595  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  44.71 
 
 		 508 aa  355  6.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  46.08 
 
 		 479 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  47.37 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  31.25 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  29.55 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  29.79 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  28.3 
 
 		 503 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  28.1 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  22.79 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  22.79 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  21.37 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  22.55 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  21.52 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.76 
 
 		 307 aa  56.2  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.7 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.38 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  21.52 
 
 		 307 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  33.78 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.64 
 
 		 300 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  26.55 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  26.55 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  26.55 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  26.55 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  26.55 
 
 		 385 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  26.55 
 
 		 410 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  27.03 
 
 		 270 aa  53.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  22.16 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  31.3 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03687  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.446663  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4168  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5250  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4271  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4036  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0208532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 300 aa  51.6  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  30.84 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4196  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0689633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 298 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.487194  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.17 
 
 		 300 aa  51.2  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2260  integrase family protein  28.57 
 
 		 395 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.46728  normal  0.0539974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  31.54 
 
 		 298 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 321 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0082  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.56 
 
 		 339 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4159  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.937296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.62 
 
 		 298 aa  50.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4177  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.225708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4229  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4277  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  34.95 
 
 		 313 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  22.72 
 
 		 362 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  36.94 
 
 		 322 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4375  site-specific tyrosine recombinase XerC  35 
 
 		 307 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  34.95 
 
 		 304 aa  50.1  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 299 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  35 
 
 		 307 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  23.68 
 
 		 306 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  32.14 
 
 		 308 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.04 
 
 		 330 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 299 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 		 311 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  30.12 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  21.63 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 372 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.59 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  43.24 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  29.66 
 
 		 299 aa  49.3  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  33.98 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.1 
 
 		 306 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  29.66 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  36.71 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  23.51 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  36.94 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.78 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  34.75 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  36.63 
 
 		 311 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.09 
 
 		 299 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.37 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.35 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.7 
 
 		 305 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.83 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.9 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0393  tyrosine recombinase XerC  31.65 
 
 		 321 aa  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0259  phage integrase  34.38 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.389161 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  31.11 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.48 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>