61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6755 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6755  integrase family protein  100 
 
 		 392 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  94.9 
 
 		 392 aa  761    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  86.48 
 
 		 411 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  32.69 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  31.36 
 
 		 402 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  30.7 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  28.61 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  28.25 
 
 		 381 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  27.13 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  27.13 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  27.13 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  27.13 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  27.13 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  27.13 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  24.19 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  25.7 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  24.01 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  35.65 
 
 		 331 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.59 
 
 		 325 aa  49.7  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  23.02 
 
 		 290 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.29 
 
 		 296 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.48 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  33.9 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  25.07 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  28.7 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.81 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  33.08 
 
 		 324 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  36.44 
 
 		 318 aa  46.6  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  27.03 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 		 317 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.12 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  39.24 
 
 		 353 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.59 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  31.93 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  33.05 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  22.87 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  31.34 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.94 
 
 		 296 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 345 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  24.25 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0057  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  29.13 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  29.46 
 
 		 308 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  26.28 
 
 		 474 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.32 
 
 		 320 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  37.21 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 421 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 317 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>