24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3590 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  100 
 
 		 286 aa  596  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  93.99 
 
 		 445 aa  550  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4396  integrase family protein  45.77 
 
 		 441 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4260  phage integrase family protein  45.77 
 
 		 441 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  40.36 
 
 		 449 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  30.83 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7602  integrase family protein  30.47 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2366  MutL protein  28.53 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00380657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0250  integrase family protein  29.79 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7324  integrase family protein  29.79 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6478  integrase family protein  29.79 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03077  hypothetical protein  29.02 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4954  integrase family protein  26.75 
 
 		 473 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2775  integrase family protein  26.75 
 
 		 473 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  27.72 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  27.72 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  24.91 
 
 		 411 aa  46.2  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0163  hypothetical protein  32.5 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  22.47 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  22.47 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  22.47 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  22.47 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  22.47 
 
 		 410 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  22.47 
 
 		 385 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>