16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7324 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010627  Bphy_7602  integrase family protein  88.31 
 
 		 482 aa  880    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6478  integrase family protein  100 
 
 		 482 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7324  integrase family protein  100 
 
 		 482 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0250  integrase family protein  100 
 
 		 482 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4954  integrase family protein  42.28 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2775  integrase family protein  42.28 
 
 		 473 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4744  site-specific recombinase, phage integrase family  29.01 
 
 		 495 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  23.78 
 
 		 449 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4260  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4396  integrase family protein  25.89 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  23.73 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  29.79 
 
 		 286 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  20.87 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03077  hypothetical protein  26 
 
 		 301 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2366  MutL protein  20.65 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00380657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>