13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03077 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03077  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  631  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  29.02 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  28.12 
 
 		 445 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4954  integrase family protein  26.53 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2775  integrase family protein  26.53 
 
 		 473 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  24.55 
 
 		 449 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4260  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4396  integrase family protein  27.54 
 
 		 441 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6478  integrase family protein  26 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7324  integrase family protein  26 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0250  integrase family protein  26 
 
 		 482 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7602  integrase family protein  35.53 
 
 		 482 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 421 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>