22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4396 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_4260  phage integrase family protein  100 
 
 		 441 aa  912    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4396  integrase family protein  100 
 
 		 441 aa  912    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  61.87 
 
 		 449 aa  569  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  49.11 
 
 		 445 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  45.77 
 
 		 286 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3588  phage integrase  52.02 
 
 		 187 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0250  integrase family protein  25.89 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7324  integrase family protein  25.89 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6478  integrase family protein  25.89 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7602  integrase family protein  27.2 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2775  integrase family protein  29.2 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4954  integrase family protein  29.2 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  27.3 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  27.3 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2366  MutL protein  24.48 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00380657  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  24.17 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03076  hypothetical protein  36 
 
 		 219 aa  53.5  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03077  hypothetical protein  27.08 
 
 		 301 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0163  hypothetical protein  30.43 
 
 		 222 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.17 
 
 		 312 aa  45.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>