More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2107 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2107  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
394 aa  785    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0027077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.5 
 
 
513 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  35.71 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  35.37 
 
 
383 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  35.71 
 
 
475 aa  88.2  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  34.52 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  35.38 
 
 
467 aa  84  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  33.07 
 
 
528 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.01 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 
497 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 
501 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.21 
 
 
501 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.57 
 
 
389 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.35 
 
 
380 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  37.31 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  35.9 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  34.57 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.85 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.82 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  33.17 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1306  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.45 
 
 
415 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692323  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  32.99 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  31.5 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  32.34 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  35.9 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  34.5 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.41 
 
 
398 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  33.85 
 
 
484 aa  79.7  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  34.33 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  34.67 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1286  serine protease  32.2 
 
 
272 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000322806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  36.5 
 
 
465 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1069  serine protease, DegP/HtrA family  32.2 
 
 
282 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000128522  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  33.83 
 
 
472 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  35.9 
 
 
545 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  35.57 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.98 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  31.09 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  32.03 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  34.34 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  32.88 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  34.5 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.92 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  34.74 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.69 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  35.2 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  34.85 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  32.14 
 
 
481 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  35.57 
 
 
446 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  35.9 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  33.51 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.5 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  33.33 
 
 
471 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.98 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  35.9 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  33.84 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  30.47 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.94 
 
 
497 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  29.65 
 
 
475 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0143  2-alkenal reductase  35.48 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0599702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.38 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  33 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  34.55 
 
 
383 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.44 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  33.5 
 
 
501 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  34.55 
 
 
458 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  32.84 
 
 
485 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  34.01 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  34.34 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  33 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  34.36 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.08 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.5 
 
 
410 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.63 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.2 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1097  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.5 
 
 
280 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0123278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  34.36 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4771  protease Do  31.16 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.411686  hitchhiker  0.000180606 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.36 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  34.36 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.57 
 
 
398 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  36.92 
 
 
476 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.36 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  30.5 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  35 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.36 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.36 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  32.14 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  32.65 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  34.52 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1286  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.87 
 
 
509 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  31.44 
 
 
511 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.95 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  31.12 
 
 
467 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  33 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  33.5 
 
 
457 aa  73.6  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>