195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1252 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 448 aa  869    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  49 
 
 		 449 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.09 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.09 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.09 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.21 
 
 		 445 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.1 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.56 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.81 
 
 		 271 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  41.5 
 
 		 290 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  42.06 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  38.78 
 
 		 275 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  38.24 
 
 		 274 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.97 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  38.46 
 
 		 273 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  38.55 
 
 		 276 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.1 
 
 		 274 aa  144  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  37.92 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  34.44 
 
 		 269 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  37.04 
 
 		 271 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  35.93 
 
 		 270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  34.07 
 
 		 274 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.43 
 
 		 276 aa  123  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  35.06 
 
 		 275 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  33.75 
 
 		 271 aa  116  7.999999999999999e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  30.08 
 
 		 275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  32.85 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  34.32 
 
 		 271 aa  111  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  35.02 
 
 		 271 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.19 
 
 		 279 aa  103  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  35.53 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  30.52 
 
 		 275 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  29.29 
 
 		 271 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  35.4 
 
 		 195 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  37.18 
 
 		 182 aa  90.1  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 		 275 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  33.99 
 
 		 181 aa  86.3  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  36.49 
 
 		 175 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  38.31 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  34.19 
 
 		 200 aa  82.4  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  34.84 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.64 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  32.92 
 
 		 184 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.39 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  32.3 
 
 		 182 aa  75.1  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.83 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  29.43 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  32.1 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.9 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  32.1 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  30.57 
 
 		 181 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.9 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  35.79 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 		 182 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  31.41 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  26.45 
 
 		 191 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  27.74 
 
 		 193 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  32.88 
 
 		 188 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  30.72 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  32.58 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.79 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  30.34 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  21.77 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  25.76 
 
 		 171 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 		 178 aa  57  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  24.61 
 
 		 182 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0983  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 		 170 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  33.02 
 
 		 166 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18511  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 		 170 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  21.9 
 
 		 167 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  22 
 
 		 172 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  32.63 
 
 		 171 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  24.5 
 
 		 156 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.74 
 
 		 180 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.03 
 
 		 180 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.23 
 
 		 176 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  29.05 
 
 		 184 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  23.79 
 
 		 227 aa  53.5  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.99 
 
 		 182 aa  53.5  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  36.46 
 
 		 182 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  30.49 
 
 		 181 aa  53.1  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 		 182 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  23.36 
 
 		 193 aa  52.8  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 		 182 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 182 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  23.94 
 
 		 194 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.03 
 
 		 180 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  21.94 
 
 		 165 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 		 164 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.2 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1029  ATP synthase F0, B subunit  22.29 
 
 		 167 aa  51.6  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.63 
 
 		 181 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>