273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0649 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
191 aa  361  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  49.69 
 
 
189 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  47.31 
 
 
182 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  50.9 
 
 
182 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  46.34 
 
 
184 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  47.59 
 
 
181 aa  124  6e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  45.96 
 
 
200 aa  124  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.83 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  49.64 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  46.58 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  41.86 
 
 
195 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  38.12 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  41.4 
 
 
181 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  43.53 
 
 
193 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.03 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  50.36 
 
 
182 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.86 
 
 
182 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  45.34 
 
 
184 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  41.03 
 
 
179 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  44.38 
 
 
193 aa  99  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  41.45 
 
 
175 aa  99  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  43.48 
 
 
182 aa  97.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  42.86 
 
 
196 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  38.64 
 
 
194 aa  95.1  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  38.41 
 
 
191 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  38.1 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  43.87 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  30.67 
 
 
172 aa  88.2  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  32.37 
 
 
171 aa  87.8  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  30.94 
 
 
166 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  35.26 
 
 
448 aa  84.7  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  38.06 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.82 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
171 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1917  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  34.67 
 
 
166 aa  82  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.409248  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  42.86 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.69 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  32.52 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  33.77 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.92 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  28.37 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1251  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  37.86 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  34.87 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.3 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.47 
 
 
445 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
175 aa  74.7  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.67 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  34.21 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  34.15 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  34.42 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
156 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  34.84 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30.26 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34.23 
 
 
168 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  34.84 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.95 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  34.84 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  32.24 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
156 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  30.56 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  24.39 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
146 aa  67.4  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.89 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.26 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  33.12 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  33.12 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>