265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2411 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  100 
 
 
179 aa  338  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  71.67 
 
 
181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  56.86 
 
 
182 aa  155  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  55.95 
 
 
181 aa  154  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  57.89 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  47.13 
 
 
200 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48.17 
 
 
192 aa  131  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  45.12 
 
 
189 aa  130  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  50.31 
 
 
188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.23 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  46.51 
 
 
182 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  43.37 
 
 
184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  40.99 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  42.53 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  46.45 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  40.26 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  43.51 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  40.12 
 
 
195 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  44.1 
 
 
193 aa  106  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  33.71 
 
 
180 aa  105  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  43.6 
 
 
182 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  38.69 
 
 
181 aa  101  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  42.14 
 
 
175 aa  99  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  42.14 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  37.65 
 
 
193 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
172 aa  91.7  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  37.72 
 
 
196 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  43.53 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  37.06 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  42.58 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.14 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  32.1 
 
 
448 aa  79.7  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.19 
 
 
445 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  34.39 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  29.86 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.48 
 
 
164 aa  72  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.26 
 
 
445 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4466  ATP synthase F0, B subunit  31.51 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000198914  hitchhiker  0.0000000113501 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  29.94 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  27.5 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  29.14 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.39 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
175 aa  65.5  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
443 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  31.45 
 
 
449 aa  64.7  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  27.61 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  28.1 
 
 
199 aa  64.3  0.0000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  28.66 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  29.14 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  29.3 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  28.19 
 
 
161 aa  63.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
175 aa  62.4  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  29.55 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
156 aa  62.8  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5023  ATP synthase F0, B subunit  27.14 
 
 
151 aa  62  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.203888  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  27.39 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  25.3 
 
 
181 aa  61.6  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
175 aa  61.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00426  F0F1 ATP synthase subunit B  29.94 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  28.66 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  27.15 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.81 
 
 
446 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.77 
 
 
174 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.62 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  26.75 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  27.4 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>