More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2604 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
181 aa  349  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0268  ATP synthase F0, B subunit  44.16 
 
 
161 aa  123  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  37.42 
 
 
162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  41.83 
 
 
163 aa  108  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  37.16 
 
 
166 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  37.5 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
164 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  35.53 
 
 
175 aa  89.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  32.92 
 
 
168 aa  88.6  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.94 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  32.89 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  33.95 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  34.87 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  31.06 
 
 
168 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  29.7 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  32.67 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
168 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
175 aa  80.5  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  31.79 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  30.43 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  34.87 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  33.97 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  26.28 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  35.66 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.52 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  34 
 
 
168 aa  77.4  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  29.93 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  30.57 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  36.03 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  28.03 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  29.52 
 
 
199 aa  74.3  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  33.78 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  32.82 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  27.81 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
175 aa  72  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  31.82 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  28.85 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  31.01 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  28.08 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  34 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  35.07 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  34 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0984  F0F1 ATP synthase subunit B'  35.16 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0199  ATP synthase F0, B subunit  33.96 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  27.67 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  21.43 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.52 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  32.69 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  28.67 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18521  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.38 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.05 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  30.94 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  28.92 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  29.94 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  32.58 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  29.8 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  36.5 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  28.38 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  23.38 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  25.68 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  30.72 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  26.97 
 
 
179 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  29.68 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.7 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 
146 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  26.53 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.45 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>