263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0859 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
165 aa  321  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  69.09 
 
 
165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  43.67 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  40.13 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  36 
 
 
178 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  38.06 
 
 
166 aa  102  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  34.97 
 
 
168 aa  101  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
168 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  34.36 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  33.74 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  33.13 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  38.16 
 
 
175 aa  98.2  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 
168 aa  97.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  34.84 
 
 
179 aa  97.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  34.93 
 
 
164 aa  95.5  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  33.77 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  36.84 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  32.5 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  32.47 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
166 aa  90.9  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  34.23 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  35.17 
 
 
203 aa  88.2  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  32.87 
 
 
206 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
175 aa  84.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  34.62 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  34.27 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  34.36 
 
 
164 aa  80.5  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  35.44 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  37.16 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.26 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  33.99 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.97 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  34.15 
 
 
175 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3740  ATP synthase F0, B subunit  25.49 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  30.34 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  29.86 
 
 
179 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  27.5 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  30.26 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  33.55 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  34.38 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  29.66 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  30.25 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  31.03 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  32.1 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3154  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.2 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  32.1 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1517  ATP synthase F0, B subunit  33.59 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  36.76 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  30.77 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  31.69 
 
 
164 aa  67.4  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  25.49 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  32.1 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  28.97 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  30.26 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.86 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  30.3 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  27.85 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  30.32 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  26.74 
 
 
193 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.91 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  27.46 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  28.95 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>