278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4493 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
179 aa  339  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  97.21 
 
 
179 aa  332  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  96.65 
 
 
179 aa  328  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  79.89 
 
 
175 aa  252  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  40.8 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  36.78 
 
 
175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  38.51 
 
 
175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  37.93 
 
 
175 aa  124  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  37.93 
 
 
175 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  37.93 
 
 
175 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  36.21 
 
 
175 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  36.31 
 
 
199 aa  106  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  34.71 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  32.77 
 
 
203 aa  95.5  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  92  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  33.53 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  38.24 
 
 
171 aa  90.9  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  34.64 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  34.12 
 
 
168 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  34.87 
 
 
178 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  32.48 
 
 
162 aa  89.4  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  34.62 
 
 
164 aa  85.9  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  30.43 
 
 
206 aa  85.1  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  34.78 
 
 
167 aa  84.7  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  34.46 
 
 
179 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  32.05 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  32.92 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.99 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  34.16 
 
 
165 aa  80.9  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  31.52 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.52 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  32.41 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0067  ATP synthase F0, B subunit  35.67 
 
 
175 aa  79.3  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  33.99 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  33.1 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  34.16 
 
 
238 aa  74.7  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  33.33 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  27.22 
 
 
176 aa  73.9  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 
166 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4611  ATP synthase F0, B subunit  32.28 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.41 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.19 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  72  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  31.51 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  31.65 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  28.29 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.13 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  30.14 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  34.18 
 
 
164 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
195 aa  67.8  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0945  F0F1-type ATP synthase, subunit B  32.28 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.765239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3135  F0F1-type ATP synthase, subunit B  32.28 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.48 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  32.28 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 
165 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  29.3 
 
 
168 aa  67  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2873  F0F1 ATP synthase subunit B  32 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.405678  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  28.57 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  29.94 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  25 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0008  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.320711  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1428  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
163 aa  64.7  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.221942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  30.38 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.27 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0063  ATP synthase F0 subunit B  29.52 
 
 
164 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  29.75 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0080  ATP synthase F0, B subunit  24.52 
 
 
181 aa  63.5  0.000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  32.73 
 
 
167 aa  63.2  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  27.22 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  31.55 
 
 
166 aa  62  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  32.1 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  28.66 
 
 
179 aa  61.6  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 
156 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1799  ATP synthase F0, B subunit  32.73 
 
 
173 aa  61.2  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.402009  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  31.46 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  29.56 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>