288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19170 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  100 
 
 
179 aa  348  3e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  51.74 
 
 
193 aa  168  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  53.09 
 
 
200 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  48.84 
 
 
194 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  53.49 
 
 
193 aa  155  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  41.86 
 
 
180 aa  148  5e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  46.07 
 
 
194 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  48.12 
 
 
189 aa  137  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  41.98 
 
 
172 aa  134  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  49.69 
 
 
179 aa  131  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  47.56 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  44.44 
 
 
181 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  42.35 
 
 
181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.38 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  48.45 
 
 
184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  46.58 
 
 
175 aa  125  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.05 
 
 
192 aa  124  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  45.34 
 
 
195 aa  124  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  48.43 
 
 
182 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  46.02 
 
 
184 aa  120  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  45.24 
 
 
188 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  44.65 
 
 
181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  42.35 
 
 
182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  42.07 
 
 
191 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  42.42 
 
 
182 aa  97.4  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  41.25 
 
 
181 aa  96.7  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  40.99 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  34.57 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  38.12 
 
 
191 aa  90.5  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  35.57 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  38.27 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
169 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
169 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
169 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  38.57 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  37.23 
 
 
171 aa  81.3  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3214  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.169914 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  35.63 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  30.56 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  30.82 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.17 
 
 
203 aa  72  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03620  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00121932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4231  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00770304  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4104  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000546623  normal  0.0856146 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5172  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000636069  hitchhiker  0.00809624 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4252  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515942  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3952  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000175461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4185  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03564  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000629937  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4258  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  normal  0.0337156 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  35.88 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  29.24 
 
 
175 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.51 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  36.36 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0294  ATP synthase F0, B subunit  33.78 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  31.29 
 
 
168 aa  67.8  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  30.82 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.31 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  28.48 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  34.27 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  35.14 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  29.25 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  33.57 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1716  ATP synthase F0, B subunit  34.38 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000198199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  32.58 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  25.47 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  31.85 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  25.62 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  29.41 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  34.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  28.77 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3063  F0F1 ATP synthase subunit B  33.85 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2386  F0F1-type ATP synthase subunit b-like protein  25 
 
 
173 aa  64.3  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.62 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0181  F0F1 ATP synthase subunit B  27.1 
 
 
167 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.78 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  27.21 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4874  F0F1 ATP synthase subunit B  35.71 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2434  F0F1 ATP synthase subunit B  31.75 
 
 
146 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0912679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.62 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  29.45 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>