274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2452 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  100 
 
 
194 aa  377  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  64.41 
 
 
193 aa  202  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  58.82 
 
 
194 aa  191  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  49.74 
 
 
200 aa  184  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  54.55 
 
 
193 aa  173  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1127  F0F1 ATP synthase subunit B  46.3 
 
 
172 aa  154  7e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  46.07 
 
 
179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  52.57 
 
 
182 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  50.54 
 
 
184 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  47.06 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0144  ATP synthase F0, B subunit  42.42 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  44.51 
 
 
181 aa  131  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  49.69 
 
 
182 aa  131  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  45.56 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  44.57 
 
 
192 aa  124  8.000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  47.37 
 
 
182 aa  122  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0332  ATP synthase F0, B subunit  48.28 
 
 
181 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.389545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  45.91 
 
 
179 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  38.37 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  42.6 
 
 
191 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  45.83 
 
 
188 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  40.44 
 
 
182 aa  106  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  41.25 
 
 
175 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  38.99 
 
 
181 aa  104  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  40.13 
 
 
181 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  42.44 
 
 
184 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2411  ATP synthase F0, subunit B  46.45 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  34.83 
 
 
175 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  34.2 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1020  F0F1 ATP synthase subunit B  32.76 
 
 
193 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  36.31 
 
 
175 aa  88.6  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11333  F0F1 ATP synthase subunit B  35.14 
 
 
171 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  31.06 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  38.64 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  31.71 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  34.01 
 
 
156 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  28.4 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1302  ATP synthase F0, B subunit  32.37 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0209065  normal  0.277498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  29.27 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  28.57 
 
 
164 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  31.69 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  33.94 
 
 
448 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
445 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3880  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.147131  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.74 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3954  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.745097  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3866  F0F1 ATP synthase subunit B  28.48 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal  0.0736112 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  31.71 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1177  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.937871  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1277  ATP synthase F0, B subunit  31.61 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.279271  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2811  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.182804  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3207  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0472132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1057  F0F1 ATP synthase subunit B  29.73 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  31.29 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  29.49 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  32.47 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  26.58 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.1 
 
 
445 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  32.85 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  33.77 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 
156 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32.05 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
443 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  31.79 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0313  ATP synthase F0, B subunit  31.41 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154955  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  32.1 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  32.09 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0323  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.190975  normal  0.601696 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  26.11 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  33.11 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  33.56 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  34.25 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  29.07 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  31.79 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  34.93 
 
 
156 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>