More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2315 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  80.9 
 
 		 445 aa  701    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 445 aa  871    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.3 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.3 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  58.3 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.73 
 
 		 446 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  45.21 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  42.44 
 
 		 449 aa  322  9.000000000000001e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 271 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  38.59 
 
 		 275 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  41.06 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  37.96 
 
 		 273 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  36.47 
 
 		 274 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.13 
 
 		 274 aa  153  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  37.26 
 
 		 275 aa  153  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  37.55 
 
 		 270 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  32.83 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  34.5 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  36.67 
 
 		 274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  35.5 
 
 		 276 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 		 269 aa  138  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  35.56 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  31 
 
 		 274 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  33.33 
 
 		 271 aa  129  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.09 
 
 		 276 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  35.56 
 
 		 274 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  31.84 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  34.32 
 
 		 271 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  34.2 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.02 
 
 		 279 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  32.1 
 
 		 275 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  32.64 
 
 		 271 aa  114  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.29 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  31.15 
 
 		 275 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  35.79 
 
 		 270 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  36.77 
 
 		 182 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.78 
 
 		 182 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  32.43 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  31.08 
 
 		 175 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  31.97 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  30.2 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  31.97 
 
 		 182 aa  75.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  29.43 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  32.65 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  34.21 
 
 		 181 aa  72.4  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  32.69 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  31.65 
 
 		 189 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 		 186 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  34.01 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  28.1 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  28.31 
 
 		 201 aa  67  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 186 aa  67  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.08 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  29.61 
 
 		 156 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.94 
 
 		 188 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.98 
 
 		 193 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.08 
 
 		 178 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.93 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 		 186 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.57 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  35.29 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  31.88 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  35.07 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.93 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  27.45 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  25.49 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  43.66 
 
 		 118 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  63.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  45.21 
 
 		 158 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.38 
 
 		 179 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1667  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 		 182 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  62  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  26.53 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  27.5 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  26.97 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.67 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.37 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  29.01 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.1 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  31.21 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>