207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_29580 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  100 
 
 
273 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  52.36 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  45.35 
 
 
275 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.07 
 
 
271 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.59 
 
 
269 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  40.88 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.86 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  42.44 
 
 
270 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  41.24 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  40.45 
 
 
269 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  45.12 
 
 
290 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  40.07 
 
 
276 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  42.8 
 
 
274 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  36.9 
 
 
271 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  36.67 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  41.3 
 
 
275 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.02 
 
 
443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.02 
 
 
443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.02 
 
 
443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  43.54 
 
 
274 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.96 
 
 
445 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 
446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  38.46 
 
 
448 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  37.96 
 
 
275 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  33.84 
 
 
449 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.77 
 
 
445 aa  142  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  38.38 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  38.01 
 
 
271 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  34.4 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.04 
 
 
276 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.07 
 
 
279 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  35.08 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  36.9 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  31.73 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  33.7 
 
 
271 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  30.17 
 
 
271 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.32 
 
 
179 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.1 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
180 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
182 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.19 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.73 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  28.14 
 
 
182 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.71 
 
 
182 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
182 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.54 
 
 
179 aa  63.5  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
182 aa  63.5  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.93 
 
 
179 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  43.08 
 
 
158 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  43.08 
 
 
158 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  30.15 
 
 
177 aa  58.9  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.03 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2330  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.03 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00362801  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  58.5  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.31 
 
 
182 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.45 
 
 
178 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
177 aa  57  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  25.45 
 
 
188 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 
176 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  47.83 
 
 
157 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.17 
 
 
182 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.36 
 
 
182 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.28 
 
 
177 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.55 
 
 
179 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
180 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.79 
 
 
177 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.87 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.98 
 
 
178 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.87 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.98 
 
 
178 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.87 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.87 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.97 
 
 
185 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.87 
 
 
177 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.98 
 
 
178 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
183 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
177 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.74 
 
 
178 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  40.48 
 
 
178 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.48 
 
 
178 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 
182 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.12 
 
 
188 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.51 
 
 
181 aa  52.4  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  37.8 
 
 
178 aa  52.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.16 
 
 
184 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  39.76 
 
 
118 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 
177 aa  52.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.37 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.37 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.11 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.75 
 
 
182 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.75 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.75 
 
 
178 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
179 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>