More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2499 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  357  5e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  61.36 
 
 
180 aa  223  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.7 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.7 
 
 
178 aa  194  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.98 
 
 
181 aa  193  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.84 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.16 
 
 
179 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  37.95 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.06 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
182 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
188 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
181 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.59 
 
 
178 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
186 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
186 aa  100  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
182 aa  99  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.81 
 
 
182 aa  98.2  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 
179 aa  97.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  34.3 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  29.05 
 
 
182 aa  94.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  31.84 
 
 
182 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  92  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
186 aa  92  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
186 aa  92  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
186 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  31.64 
 
 
177 aa  89  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 
179 aa  88.2  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
180 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  31.61 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  30.11 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.49 
 
 
185 aa  85.5  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 
194 aa  84.7  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
183 aa  84.7  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
180 aa  84.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.79 
 
 
188 aa  84.3  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  30.39 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
201 aa  82  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
179 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  33.71 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.1 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  31.87 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  28.81 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1977  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.27166  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
183 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  29.83 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
188 aa  77.4  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  30.51 
 
 
196 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  30 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>