292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5022 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
178 aa  356  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  55.31 
 
 
179 aa  208  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  44.25 
 
 
182 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  41.04 
 
 
182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  38.01 
 
 
202 aa  124  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  35.96 
 
 
184 aa  110  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  39.05 
 
 
182 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  35.09 
 
 
186 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
181 aa  98.2  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.91 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  90.9  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
181 aa  90.9  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  32.02 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
182 aa  87.8  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.73 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
190 aa  85.9  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.29 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.36 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
193 aa  79.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  28.4 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  30.17 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  31.18 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.49 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  29.07 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.29 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  27.07 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.98 
 
 
180 aa  72  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  28.9 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.64 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
178 aa  71.2  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  32.79 
 
 
190 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.57 
 
 
182 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
179 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.43 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  24 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  29.24 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  29.24 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  28.16 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>