More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4260 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  357  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  70 
 
 
180 aa  267  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  67.78 
 
 
180 aa  259  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  67.22 
 
 
180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  65.56 
 
 
180 aa  245  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.78 
 
 
180 aa  197  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.78 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.78 
 
 
180 aa  162  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.22 
 
 
183 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.55 
 
 
179 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  37.85 
 
 
179 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.07 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.87 
 
 
179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.87 
 
 
193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.43 
 
 
179 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.11 
 
 
183 aa  121  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
182 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  34.13 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
178 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
178 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  30.56 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.97 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.18 
 
 
179 aa  108  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  34.46 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
186 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
181 aa  106  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
179 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
190 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  105  5e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
182 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.23 
 
 
180 aa  102  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.36 
 
 
181 aa  100  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
180 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
179 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
179 aa  100  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
180 aa  99  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.42 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
186 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
190 aa  97.8  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
201 aa  97.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
179 aa  97.8  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
178 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
186 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  29.59 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  35.67 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
181 aa  95.9  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  27.53 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
186 aa  95.1  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
186 aa  95.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.37 
 
 
186 aa  94.4  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
189 aa  94.4  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  94.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  29.94 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  29.59 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.26 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  92  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  31.46 
 
 
180 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
175 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.5 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 
178 aa  91.3  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
188 aa  91.3  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  29.44 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.54 
 
 
177 aa  90.9  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
193 aa  90.9  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  37.57 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  28.99 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  36.99 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 
183 aa  88.2  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
179 aa  87.8  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
180 aa  87.8  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  31.76 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  28.4 
 
 
190 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 
186 aa  87.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  30.06 
 
 
178 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  34.1 
 
 
177 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
179 aa  87  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  31.03 
 
 
184 aa  86.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>