More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0988 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
183 aa  355  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  69.95 
 
 
183 aa  254  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  69.4 
 
 
183 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.63 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  54.75 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.74 
 
 
183 aa  185  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.36 
 
 
180 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  39.66 
 
 
179 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
180 aa  121  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
180 aa  120  9e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
180 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.79 
 
 
183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  35.26 
 
 
176 aa  105  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.91 
 
 
179 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
183 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  35.06 
 
 
194 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35 
 
 
182 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.21 
 
 
186 aa  102  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.91 
 
 
193 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.91 
 
 
179 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.91 
 
 
179 aa  99.8  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  35.23 
 
 
188 aa  99  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  33.89 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  38.24 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  33.91 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  36.31 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.88 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
186 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
182 aa  95.1  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  32.97 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  34.29 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  33.33 
 
 
185 aa  94.4  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.25 
 
 
179 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  36.05 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  34.52 
 
 
189 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  35.71 
 
 
189 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
186 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 
184 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.63 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.88 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
186 aa  87.8  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
183 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.7 
 
 
179 aa  87  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.33 
 
 
186 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
182 aa  87.4  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
190 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  86.3  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  37.13 
 
 
190 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  32.56 
 
 
190 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.73 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.73 
 
 
185 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
180 aa  84.3  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  32.57 
 
 
190 aa  84.3  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
181 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  28.02 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  32.53 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.86 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
182 aa  83.6  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.2 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  33.9 
 
 
196 aa  82  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
180 aa  81.3  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  30.29 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.93 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  29.89 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  29.89 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.71 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  29.44 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.95 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  27.49 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.54 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.71 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>