281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1468 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
189 aa  367  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  93.65 
 
 
189 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  92.18 
 
 
179 aa  325  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  77.89 
 
 
190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  75.79 
 
 
190 aa  280  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  76.84 
 
 
190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.83 
 
 
186 aa  205  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.28 
 
 
186 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.28 
 
 
186 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  55 
 
 
186 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.19 
 
 
186 aa  197  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.46 
 
 
186 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  54.05 
 
 
201 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.12 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.2 
 
 
186 aa  180  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.2 
 
 
186 aa  180  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.8 
 
 
186 aa  180  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.12 
 
 
180 aa  179  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
188 aa  177  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  52.46 
 
 
194 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
188 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.78 
 
 
193 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  51.38 
 
 
188 aa  167  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.51 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  48.15 
 
 
190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.05 
 
 
186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  40.34 
 
 
186 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  40.34 
 
 
186 aa  135  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  38.64 
 
 
186 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  40.91 
 
 
217 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 
186 aa  131  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.11 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  39.77 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.78 
 
 
184 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  44.44 
 
 
211 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  37.79 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  36.11 
 
 
194 aa  115  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  36.72 
 
 
197 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  36.87 
 
 
179 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
179 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
179 aa  99  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.54 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 
180 aa  96.3  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.32 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  34.66 
 
 
198 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.22 
 
 
182 aa  94  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.05 
 
 
182 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.52 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 
179 aa  89  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
180 aa  87.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
184 aa  85.9  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.12 
 
 
178 aa  84.7  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  33.94 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.31 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
185 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.28 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.14 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.73 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  27.37 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  27.65 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  26.04 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  27.88 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.88 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  24.57 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  30.17 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  28.32 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
180 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  28.74 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>