More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2399 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
190 aa  370  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.74 
 
 
184 aa  177  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.87 
 
 
186 aa  165  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.45 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.29 
 
 
186 aa  164  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.33 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.78 
 
 
188 aa  161  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  47.51 
 
 
186 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.13 
 
 
186 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  45.5 
 
 
194 aa  157  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.24 
 
 
193 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.4 
 
 
186 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.98 
 
 
186 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.46 
 
 
180 aa  154  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  44.02 
 
 
201 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  46.41 
 
 
186 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  46.41 
 
 
186 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.4 
 
 
186 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.56 
 
 
188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.81 
 
 
186 aa  150  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.11 
 
 
186 aa  149  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.11 
 
 
186 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.22 
 
 
186 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  45.86 
 
 
186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  43.01 
 
 
217 aa  141  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  40 
 
 
186 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  43.93 
 
 
190 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  44.38 
 
 
194 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  41.62 
 
 
190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  40.11 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  40.11 
 
 
189 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  38.64 
 
 
197 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  40 
 
 
179 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  41.04 
 
 
198 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  42.78 
 
 
211 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  38.55 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  38.82 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  41.01 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  36.41 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  41.81 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  37.65 
 
 
179 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 
179 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
180 aa  101  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  35.43 
 
 
178 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  33.14 
 
 
220 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  34.46 
 
 
178 aa  99  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
182 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  30.51 
 
 
205 aa  92  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
179 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
179 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
182 aa  91.3  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  31.43 
 
 
177 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.93 
 
 
192 aa  89.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
178 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
179 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
193 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.05 
 
 
180 aa  89  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
180 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.68 
 
 
180 aa  89  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
178 aa  88.2  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 
181 aa  87.8  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  32 
 
 
227 aa  87  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
178 aa  87  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.74 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  30.54 
 
 
218 aa  87  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
178 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.95 
 
 
176 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.74 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.56 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.28 
 
 
178 aa  86.3  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
183 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  29.78 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.16 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.56 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  31.89 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0144  ATP synthase F1, delta subunit  28.82 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.000353318  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.42 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  39.42 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  28.33 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>