More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1678 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
197 aa  385  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  50.56 
 
 
198 aa  170  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.89 
 
 
186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  40 
 
 
194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.64 
 
 
190 aa  125  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  41.48 
 
 
201 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.36 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.8 
 
 
188 aa  118  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.6 
 
 
193 aa  118  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.86 
 
 
186 aa  118  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.86 
 
 
186 aa  117  7e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  38.07 
 
 
217 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.72 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 
190 aa  114  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.86 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.71 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.43 
 
 
180 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  36.72 
 
 
189 aa  112  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
186 aa  111  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.83 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  35.03 
 
 
189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  38.98 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.23 
 
 
184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.42 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  37.5 
 
 
186 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
186 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 
186 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  33.69 
 
 
190 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
186 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  34.46 
 
 
179 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  35.39 
 
 
194 aa  107  1e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  32.99 
 
 
196 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  35.59 
 
 
190 aa  105  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  38.98 
 
 
186 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  36.52 
 
 
190 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  33.52 
 
 
186 aa  99  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 
179 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  32.07 
 
 
188 aa  92.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  37.22 
 
 
179 aa  90.5  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
179 aa  89  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.92 
 
 
181 aa  85.9  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
180 aa  85.5  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.93 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.7 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 
182 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  33.53 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 
180 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  26.14 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  29.41 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.33 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.33 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.33 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.07 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.33 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0190  F0F1 ATP synthase subunit delta  39 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459232 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.46 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.58 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.78 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  29.41 
 
 
192 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.63 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
179 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  31.11 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_500  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0258764  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  32.2 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.48 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0561  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.132233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.7 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.7 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
193 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.88 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2330  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.42 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00362801  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>