More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0464 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
182 aa  96.3  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
181 aa  92  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  28.49 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0860  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.05 
 
 
178 aa  84.3  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0783564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  30.59 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.09 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.22 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.59 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.28 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1936  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.18 
 
 
186 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.28 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
193 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  29.59 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  27.01 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  25.71 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
180 aa  72  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
177 aa  72  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
177 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.42 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.4 
 
 
182 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  32.74 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.16 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  28.9 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  27.95 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  25.88 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.65 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 
180 aa  65.1  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.84 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  24.71 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.35 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.26 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.42 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  25.88 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.44 
 
 
182 aa  63.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  28.24 
 
 
209 aa  63.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>