More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3173 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.22 
 
 
180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.33 
 
 
180 aa  202  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.78 
 
 
180 aa  197  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.67 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.11 
 
 
180 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.56 
 
 
180 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.59 
 
 
179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.31 
 
 
179 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  35.59 
 
 
179 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.75 
 
 
179 aa  124  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.75 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.78 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  39.05 
 
 
192 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
183 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.97 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
182 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.71 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
190 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.72 
 
 
181 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
180 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 
180 aa  105  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.43 
 
 
182 aa  102  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  30.34 
 
 
179 aa  101  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.29 
 
 
178 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.98 
 
 
181 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.37 
 
 
178 aa  100  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
181 aa  99.4  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  35.88 
 
 
179 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.97 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.63 
 
 
180 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.93 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
188 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.3 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  30.34 
 
 
201 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
190 aa  92.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  31.11 
 
 
182 aa  92.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  36.59 
 
 
188 aa  92  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  34.12 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
193 aa  91.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
180 aa  91.3  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.32 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.2 
 
 
179 aa  91.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
179 aa  90.9  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  33.53 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
184 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.78 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  27.53 
 
 
186 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  27.53 
 
 
186 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
185 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  29.59 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
179 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
186 aa  87  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.73 
 
 
182 aa  87  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
179 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  33.94 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.57 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
188 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.14 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.84 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.38 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  28.99 
 
 
179 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
177 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  35.15 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  28.74 
 
 
194 aa  84.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
186 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>