More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1046 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
186 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  63.44 
 
 
186 aa  233  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  63.44 
 
 
186 aa  233  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  63.98 
 
 
217 aa  231  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  63.44 
 
 
186 aa  230  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  61.83 
 
 
186 aa  223  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.31 
 
 
186 aa  177  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.24 
 
 
186 aa  177  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.24 
 
 
186 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  52.75 
 
 
211 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.19 
 
 
180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.62 
 
 
188 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.51 
 
 
190 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.38 
 
 
193 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.82 
 
 
186 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.32 
 
 
186 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.38 
 
 
186 aa  158  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.94 
 
 
188 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.78 
 
 
186 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.4 
 
 
188 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.82 
 
 
186 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  43.33 
 
 
201 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.47 
 
 
186 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.62 
 
 
186 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.54 
 
 
186 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.36 
 
 
184 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  39.77 
 
 
194 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  38.8 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  39.56 
 
 
190 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 
189 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  36.57 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  36.57 
 
 
179 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  37.7 
 
 
190 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  38.46 
 
 
190 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  39.88 
 
 
179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  36.51 
 
 
188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  38.98 
 
 
197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  37.06 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.66 
 
 
182 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  35.2 
 
 
198 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.69 
 
 
193 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  32.37 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  32.4 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
179 aa  95.5  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
179 aa  94.4  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.29 
 
 
179 aa  91.3  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  32.18 
 
 
220 aa  88.6  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
180 aa  88.2  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.26 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.61 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  31.71 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03280  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.84 
 
 
184 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.65 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  26.82 
 
 
205 aa  79  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  34.86 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.16 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.14 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.34 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.03 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.02 
 
 
185 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  27.75 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1699  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.02 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.315472  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  30.72 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.82 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  31.49 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  30.29 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.71 
 
 
180 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.59 
 
 
177 aa  72.4  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  28.96 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>