More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2244 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  357  4e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  61.36 
 
 
180 aa  223  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.74 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.07 
 
 
181 aa  195  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
178 aa  184  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.6 
 
 
181 aa  181  7e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  174  5e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  39.51 
 
 
192 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.29 
 
 
180 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
180 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
190 aa  101  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.34 
 
 
181 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.63 
 
 
180 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
182 aa  100  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.48 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  34.68 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.9 
 
 
179 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 
188 aa  98.2  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
179 aa  98.2  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.25 
 
 
180 aa  98.2  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  34.91 
 
 
190 aa  97.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.41 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
180 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  35.03 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  35.03 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
201 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.71 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.29 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.29 
 
 
179 aa  91.7  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
188 aa  91.7  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  26.16 
 
 
179 aa  90.9  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.08 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  30.81 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
186 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.04 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 
180 aa  89  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  31.95 
 
 
217 aa  89.4  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  28.89 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  30.95 
 
 
188 aa  88.6  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  30.17 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.17 
 
 
178 aa  87.8  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.58 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  35.03 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.24 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.17 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.62 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.82 
 
 
186 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
186 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.18 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  33.71 
 
 
217 aa  84.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  28.82 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.76 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
186 aa  83.2  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  29.05 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 
186 aa  83.6  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  27.44 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.73 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  31.61 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  32 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
178 aa  82  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
184 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.61 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  30.9 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  30.06 
 
 
177 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  29.24 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.25 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
182 aa  79  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
178 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  29.55 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  30.18 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.98 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1977  ATP synthase F1, delta subunit  27.53 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.27166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>