More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0019 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
178 aa  356  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  96.63 
 
 
178 aa  344  3e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
178 aa  184  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.78 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.78 
 
 
179 aa  179  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.75 
 
 
178 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.75 
 
 
178 aa  177  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
179 aa  177  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  177  9e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
179 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  49.44 
 
 
179 aa  175  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.56 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.04 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.96 
 
 
180 aa  168  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.31 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.49 
 
 
180 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.3 
 
 
180 aa  157  6e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.3 
 
 
180 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.02 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.38 
 
 
179 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.13 
 
 
177 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.82 
 
 
176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.58 
 
 
179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.48 
 
 
183 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  43.82 
 
 
176 aa  142  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  40.68 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  38.98 
 
 
178 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  36.72 
 
 
178 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0212  ATP synthase F1, delta subunit  44.07 
 
 
177 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.59 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  37.78 
 
 
178 aa  107  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.29 
 
 
175 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.27 
 
 
178 aa  104  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  36.16 
 
 
178 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.52 
 
 
179 aa  102  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 
178 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  34.83 
 
 
178 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  35.75 
 
 
177 aa  99  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0488  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.75 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.168229  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0427  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.21 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0288097  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  33.9 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  33.9 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  32.61 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
180 aa  91.7  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.03 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
178 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3733  ATP synthase F1, delta subunit  32.2 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  32.07 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03110  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.46 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  32.56 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  33.9 
 
 
178 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2810  ATP synthase F1, delta subunit  35.39 
 
 
179 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.706579  normal  0.375385 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3206  ATP synthase F1, delta subunit  35.39 
 
 
179 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.496834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.99 
 
 
180 aa  88.6  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.09 
 
 
178 aa  88.6  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
178 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  31.93 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
178 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
178 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
178 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  31.52 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  33.53 
 
 
178 aa  85.5  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
178 aa  85.5  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  33.89 
 
 
178 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.15 
 
 
180 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 
177 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.39 
 
 
177 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
181 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.89 
 
 
179 aa  79  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
186 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  77.8  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.83 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.31 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.46 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>