More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4741 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
196 aa  383  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.54 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.54 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.09 
 
 
188 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.43 
 
 
186 aa  152  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.54 
 
 
188 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.37 
 
 
186 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  45.21 
 
 
194 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.36 
 
 
188 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  47.73 
 
 
179 aa  144  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.51 
 
 
186 aa  142  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  46.78 
 
 
193 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.6 
 
 
186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.19 
 
 
186 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.88 
 
 
180 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.71 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.86 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.28 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  41.76 
 
 
201 aa  124  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.71 
 
 
186 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.82 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.61 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7383  ATP synthase F1, delta subunit  39.53 
 
 
190 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.705381  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1468  ATP synthase F1, delta subunit  37.79 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.260461 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  41.76 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1747  ATP synthase F1, delta subunit  36.05 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.409884  normal  0.151346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1469  ATP synthase F1, delta subunit  36.05 
 
 
179 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6638  ATP synthase F1, delta subunit  38.37 
 
 
190 aa  112  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  38.8 
 
 
190 aa  111  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  37.06 
 
 
186 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  32.99 
 
 
197 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.42 
 
 
179 aa  106  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0111  ATP synthase F1, delta subunit  37.08 
 
 
194 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  38.12 
 
 
188 aa  102  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0606  ATP synthase F1, delta subunit  35.88 
 
 
190 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.226386  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  36.47 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  34.71 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  34.71 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  31.58 
 
 
186 aa  94.4  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
179 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
181 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
180 aa  85.1  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  35.29 
 
 
186 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  29.7 
 
 
185 aa  84.7  8e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  35.06 
 
 
211 aa  84.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  31.14 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.95 
 
 
178 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.72 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.9 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  32.16 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
180 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.05 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  32.34 
 
 
220 aa  77.8  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  31.33 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.4 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
179 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 
180 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2847  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.187337 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  30.63 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  33.92 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  27.65 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  30.12 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  28.41 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.38 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  29.21 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  31.1 
 
 
178 aa  74.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0082  H+-transporting two-sector ATPase, delta(OSCP) subunit  28.48 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.88 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  30.77 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
183 aa  72  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.7 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>