More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3134 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  97.21 
 
 
179 aa  342  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.76 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.16 
 
 
179 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.95 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.16 
 
 
193 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.07 
 
 
180 aa  97.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.37 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
183 aa  92  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
180 aa  87.4  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
183 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81978  F1F0-ATPase subunit  29.65 
 
 
205 aa  85.1  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.581266  normal  0.944639 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  28.82 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 
180 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  32.73 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.18 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.79 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.41 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
178 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
182 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 
184 aa  77.8  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.2 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  30.36 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  28.76 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  33.14 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  26.01 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  28.9 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.59 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2089  ATP synthase F1, delta subunit  26.9 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  27.12 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  27.12 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.54 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.65 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  31.84 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  28.32 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.86 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 
182 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
180 aa  70.9  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
176 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.07 
 
 
180 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.16 
 
 
188 aa  70.5  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  29.7 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  27.68 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  26.97 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.74 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.07 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
186 aa  68.6  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
182 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.86 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.43 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  30.34 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.95 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.56 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.56 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.19 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.67 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 
183 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.67 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 
175 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.14 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  25.75 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  26.63 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  25.88 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  27.22 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>