More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0369 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
180 aa  351  2.9999999999999997e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  76.11 
 
 
180 aa  283  9e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  76.11 
 
 
180 aa  283  9e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0417  F0F1 ATP synthase subunit delta  79.44 
 
 
179 aa  278  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.497202  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  67.22 
 
 
176 aa  243  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0109  F0F1 ATP synthase subunit delta  65 
 
 
176 aa  233  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00162422  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  66.3 
 
 
183 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  62.84 
 
 
179 aa  224  7e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  63.39 
 
 
177 aa  220  9e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  63.33 
 
 
176 aa  214  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.55 
 
 
177 aa  187  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  53.33 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.67 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.2 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.65 
 
 
179 aa  176  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.97 
 
 
179 aa  175  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.35 
 
 
179 aa  174  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.1 
 
 
179 aa  173  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.55 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.35 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.55 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.1 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.55 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.55 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.55 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
178 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
178 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  48.89 
 
 
178 aa  168  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  48.6 
 
 
178 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  47.49 
 
 
178 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  48.62 
 
 
178 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.44 
 
 
178 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0212  ATP synthase F1, delta subunit  47.19 
 
 
177 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3077  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.66 
 
 
178 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26673  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  39.89 
 
 
178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  38.76 
 
 
178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3733  ATP synthase F1, delta subunit  35.91 
 
 
177 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 
177 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.57 
 
 
178 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.01 
 
 
178 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2872  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
179 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  37.64 
 
 
178 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  36.41 
 
 
178 aa  104  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  38.67 
 
 
178 aa  104  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.91 
 
 
178 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.91 
 
 
178 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.44 
 
 
177 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  35.6 
 
 
177 aa  101  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  33.52 
 
 
177 aa  99.4  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.25 
 
 
177 aa  98.2  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
177 aa  97.8  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2145  ATP synthase F1, delta subunit  33.7 
 
 
185 aa  96.3  2e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2168  ATP synthase F1, delta subunit  34.25 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000494918  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  35.39 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 
178 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0009  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.83 
 
 
178 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
177 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  32.6 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  33.15 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 
178 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4258  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 
178 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.39 
 
 
178 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4078  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.079303  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4093  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4149  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.95 
 
 
177 aa  92.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0979605  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03619  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00523657  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4232  ATP synthase F1, delta subunit  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.245958  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4251  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538372  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5171  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00189703  decreased coverage  0.00512499 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03563  hypothetical protein  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4259  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000372939  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2525  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.4 
 
 
177 aa  92  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.046669  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4103  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00374645  normal  0.126439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3951  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000356722  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4186  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.09 
 
 
177 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000191061  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
177 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.8 
 
 
177 aa  91.7  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 
180 aa  91.3  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3928  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0640299  hitchhiker  0.00610121 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4020  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.183968  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0005  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.38 
 
 
177 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  35.91 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
177 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3959  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.78 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.307164  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.6 
 
 
177 aa  90.1  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
177 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.52 
 
 
177 aa  89  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>