More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2620 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
184 aa  367  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  65.57 
 
 
185 aa  257  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  65.57 
 
 
185 aa  257  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  55.06 
 
 
182 aa  220  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  59.67 
 
 
185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.71 
 
 
183 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  56.07 
 
 
184 aa  202  2e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.43 
 
 
180 aa  160  9e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.88 
 
 
180 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.43 
 
 
182 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.04 
 
 
180 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.73 
 
 
180 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.73 
 
 
180 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.14 
 
 
182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  36 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.43 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.26 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.93 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.26 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.56 
 
 
182 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.67 
 
 
183 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 
182 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.1 
 
 
180 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
181 aa  100  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  35.33 
 
 
182 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32540  F-ATPase family transporter: protons (chloroplast)  32.18 
 
 
217 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  99.8  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.54 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.8  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 
180 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  34.27 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
180 aa  95.9  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  34.16 
 
 
188 aa  94.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 
179 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.48 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
180 aa  94  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2585  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
183 aa  94  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.793853  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.76 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
183 aa  91.7  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  28.49 
 
 
179 aa  92  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.34 
 
 
183 aa  90.9  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.95 
 
 
180 aa  90.9  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  30.81 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  30.43 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 
180 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0200  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
175 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0296098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  26.32 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.4 
 
 
178 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4621  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 
176 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  28.16 
 
 
178 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.06 
 
 
183 aa  88.2  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 
175 aa  87.8  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.06 
 
 
181 aa  87.4  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
178 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.63 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  29.76 
 
 
192 aa  85.1  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  28.24 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  28 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4335  ATP synthase F1, delta subunit  32.53 
 
 
179 aa  84.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000408074  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00424  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.65 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.77 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002027  ATP synthase delta chain  30.23 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.002001  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  25.86 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  27.59 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.98 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.74 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.4 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.55 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.17 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  25.42 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  29.78 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.95 
 
 
179 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  27.91 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.76 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  26.74 
 
 
173 aa  78.2  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.82 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  29.65 
 
 
177 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0179  ATP synthase delta chain  29.57 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>