265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0395 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 
182 aa  359  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3213  ATP synthase F1, delta subunit  40.35 
 
 
179 aa  140  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0182  ATPase, delta subunit (H(+)-transporting two-sector ATPase)  40.66 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.861028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1232  ATP synthase F1, delta subunit  40.76 
 
 
186 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5022  ATP synthase F1, delta subunit  44.25 
 
 
178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.557058  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  34.81 
 
 
184 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  37.14 
 
 
182 aa  112  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  32.77 
 
 
202 aa  105  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  34.43 
 
 
177 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.33 
 
 
184 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 
182 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.64 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.77 
 
 
179 aa  95.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.12 
 
 
180 aa  94.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.84 
 
 
180 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.11 
 
 
186 aa  93.2  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  34.5 
 
 
179 aa  92.8  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.53 
 
 
180 aa  91.3  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.2 
 
 
179 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
182 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.27 
 
 
182 aa  87.8  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.15 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.42 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.51 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 
180 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1491  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.32 
 
 
185 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154194  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.44 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.18 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.89 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 
180 aa  82  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.99 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
180 aa  80.9  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.7 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.7 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.7 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.7 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.7 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.81 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.57 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  29.94 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2381  ATP synthase F1, delta subunit  27.27 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0533596 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  28.31 
 
 
182 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0110  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2828  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.24 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.47 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  31.36 
 
 
186 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2192  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.96 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  31.71 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.21 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5433  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5430  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.75 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0498007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5486  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.151912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4038  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00667961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.14 
 
 
185 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0988  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.78 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0577519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5521  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.14 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000263908  hitchhiker  0.00000000000000110124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5106  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.11 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.61934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3173  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.52 
 
 
180 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.461622  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.41 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.41 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3461  ATP synthase F1, delta subunit  26.09 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.330748  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.01 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2185  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.8 
 
 
183 aa  72  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.21 
 
 
179 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.81 
 
 
186 aa  70.9  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.75 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.99 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1872  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  26.32 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0335  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.584491  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  24.85 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2612  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.75 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.47 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.44 
 
 
180 aa  68.2  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.51 
 
 
271 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  25.57 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.55 
 
 
179 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  27.75 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2488  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.11 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000402457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.34 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.04 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3959  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.54 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.307164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>