294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6139 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 275 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  53.09 
 
 		 273 aa  252  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  44.73 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.79 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  46.49 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.16 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  44.24 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  46.76 
 
 		 290 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.59 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.65 
 
 		 445 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  43.59 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  41.97 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.35 
 
 		 443 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.35 
 
 		 443 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.35 
 
 		 443 aa  175  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  40.89 
 
 		 276 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  40.07 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.6 
 
 		 445 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  41.42 
 
 		 448 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.91 
 
 		 446 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  37.19 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  40.74 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  38.21 
 
 		 449 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  35.2 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  41.11 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  38.83 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  39.68 
 
 		 275 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  35.6 
 
 		 275 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.61 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  34.98 
 
 		 275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.35 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  38.02 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  31.73 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  36.61 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  36.86 
 
 		 270 aa  102  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 179 aa  86.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.86 
 
 		 179 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.94 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  32.36 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  32 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.89 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.47 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  28.99 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.71 
 
 		 181 aa  72  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.81 
 
 		 186 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.71 
 
 		 179 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4048  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.64 
 
 		 177 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572688  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  26.47 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.07 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.17 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2027  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.84 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.0511628 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2330  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.84 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00362801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  39.26 
 
 		 178 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.57 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.49 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1241  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.67 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.36 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3755  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.21 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.267371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  50.75 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.17 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  52.17 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.9 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  29.29 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.19 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.12 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  34.72 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  27.33 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1028  ATP synthase F1, delta subunit  24.18 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0059  ATP synthase F1, delta subunit  53.85 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.52 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.1 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0515  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  46.97 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.169103  normal  0.589792 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.52 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  32.86 
 
 		 178 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.86 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3514  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.04 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  28 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.86 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.86 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.86 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.78 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4133  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.45 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0221987  normal  0.0205692 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4489  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.76 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0316955  hitchhiker  0.00000555813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  32.46 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4750  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.28 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4313  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.78 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.324517  hitchhiker  0.0000000000831878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4510  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.78 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0612769  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4368  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.78 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261207  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4369  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.78 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00752836  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  43.28 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3733  ATP synthase F1, delta subunit  25.81 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  29.93 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  42.42 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.99 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3647  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.76 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000294276  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>