275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11334 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 446 aa  867    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.72 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.72 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  57.72 
 
 		 443 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.73 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  56.73 
 
 		 445 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  41.91 
 
 		 449 aa  313  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  41.56 
 
 		 448 aa  306  7e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  40.91 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.82 
 
 		 271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  37.88 
 
 		 274 aa  154  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  42.11 
 
 		 290 aa  153  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  37.18 
 
 		 273 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  39.02 
 
 		 275 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.33 
 
 		 274 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  37.5 
 
 		 276 aa  141  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  40 
 
 		 274 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  35.51 
 
 		 274 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 269 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  32.97 
 
 		 269 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  34.13 
 
 		 275 aa  129  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  34.8 
 
 		 270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  36.2 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  39.33 
 
 		 274 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  32.38 
 
 		 271 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  34.67 
 
 		 271 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.71 
 
 		 276 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  35.8 
 
 		 271 aa  111  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.75 
 
 		 279 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  33.07 
 
 		 271 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  31.87 
 
 		 271 aa  103  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  31.56 
 
 		 271 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  27.35 
 
 		 275 aa  94.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.81 
 
 		 278 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  31.87 
 
 		 270 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  30.12 
 
 		 275 aa  87  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  34.84 
 
 		 182 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  34.69 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  32.21 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  32.19 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  32.88 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  33.12 
 
 		 200 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  31.76 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.29 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.25 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  29.68 
 
 		 184 aa  67.8  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  32.9 
 
 		 193 aa  67  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  31.03 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.92 
 
 		 180 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.55 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  33.11 
 
 		 181 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  30.2 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  28.73 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.25 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  33.33 
 
 		 194 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.35 
 
 		 182 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  32.12 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  30.86 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.14 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  25.66 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0189  F0F1 ATP synthase subunit B  33.8 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  26.8 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  26.32 
 
 		 156 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  29.11 
 
 		 193 aa  58.9  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  26.14 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  25.45 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  29.49 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  31.33 
 
 		 196 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  30.97 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.5 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.41 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  26.14 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  28.21 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  29.38 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  27.71 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1268  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  42.47 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1266  ATP synthase F0, B subunit  30.94 
 
 		 188 aa  57  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140987 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  25.49 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  26.32 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  43.43 
 
 		 157 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.870325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  23.03 
 
 		 166 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08140  ATP synthase, F0 subunit b  32.88 
 
 		 184 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0556  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 		 186 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0985785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.19 
 
 		 186 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>