133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3633 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 274 aa  522  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  89.78 
 
 		 274 aa  454  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  48.34 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  42.97 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.91 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  43.54 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  38.24 
 
 		 274 aa  168  7e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  44.18 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  40.5 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  39.76 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  41.9 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  41.84 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  39.78 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.7 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  37.31 
 
 		 271 aa  152  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.98 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.15 
 
 		 445 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.59 
 
 		 449 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  37.78 
 
 		 274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  41.64 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.08 
 
 		 274 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  41.56 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.02 
 
 		 446 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.56 
 
 		 445 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.58 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.58 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.58 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  32.85 
 
 		 448 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  38.81 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  34.71 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.45 
 
 		 279 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  35.15 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.88 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  31.45 
 
 		 275 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  33.87 
 
 		 275 aa  119  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.6 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  34.71 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  28.22 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.59 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  27.54 
 
 		 179 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.35 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.54 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.35 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  31.96 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.84 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.42 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.39 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.12 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  30.32 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  30.32 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.97 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.21 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  36.26 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  36.54 
 
 		 186 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  27.78 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  27.48 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  30.6 
 
 		 179 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 		 181 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 		 180 aa  53.5  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0464  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.38 
 
 		 180 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.375787  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  38.36 
 
 		 179 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.04 
 
 		 201 aa  52.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0268  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.57 
 
 		 186 aa  52.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30 
 
 		 179 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 180 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.52 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.71 
 
 		 180 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.24 
 
 		 178 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  27.52 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.49 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 182 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.18 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.44 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.54 
 
 		 180 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  28.65 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.49 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.35 
 
 		 193 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 		 178 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  23.67 
 
 		 182 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  26.19 
 
 		 179 aa  49.7  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.77 
 
 		 186 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 		 179 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.49 
 
 		 179 aa  48.9  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.74 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 		 182 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  30.95 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 186 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4069  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  40.58 
 
 		 118 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0429  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.17 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0946  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.14 
 
 		 179 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  24.41 
 
 		 185 aa  47  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.06 
 
 		 188 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>