247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4139 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 290 aa  545  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  49.58 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  49.59 
 
 		 275 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.71 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.64 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  41.72 
 
 		 274 aa  179  5.999999999999999e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  45.12 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.3 
 
 		 445 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.97 
 
 		 443 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.97 
 
 		 443 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.97 
 
 		 443 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  46.5 
 
 		 271 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  43.45 
 
 		 275 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  41.5 
 
 		 448 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.48 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  44.98 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  43.08 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  40.98 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  42.8 
 
 		 269 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.11 
 
 		 446 aa  159  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  39.92 
 
 		 449 aa  157  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  38.71 
 
 		 275 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  40.08 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.06 
 
 		 445 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.71 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  41.9 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.52 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  38.98 
 
 		 274 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  43.07 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  38.43 
 
 		 271 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  39.36 
 
 		 275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  35.77 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  32.94 
 
 		 275 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  38.02 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  34.8 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.65 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  34 
 
 		 271 aa  88.2  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  31.33 
 
 		 179 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  26.67 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.52 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  30.72 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  26.83 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.92 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.62 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  31.37 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.36 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.67 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.19 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0662  F0F1-type ATP synthase, delta subunit  28.46 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.32 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.04 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  31.87 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 		 184 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 		 178 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3739  ATP synthase F1, delta subunit  25.75 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.06 
 
 		 178 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.95 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  29.84 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0064  ATP synthase F1 subunit delta  27.16 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.21 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  25.77 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.93 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  40 
 
 		 190 aa  58.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.71 
 
 		 180 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.83 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.75 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  31.16 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.85 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.93 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2244  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.95 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0535  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.29 
 
 		 180 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0191056  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.08 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.08 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.1 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 181 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0067  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.49 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0741932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.66 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 		 186 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0174  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.95 
 
 		 186 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1715  ATP synthase F1, delta subunit  26.42 
 
 		 182 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000459398  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.66 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.39 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.93 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.39 
 
 		 179 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 		 186 aa  53.9  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  44.26 
 
 		 178 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.66 
 
 		 179 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.66 
 
 		 179 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.66 
 
 		 179 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.66 
 
 		 179 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.52 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.93 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.2 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>