193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1304 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 271 aa  510  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  51.29 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  57.2 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  44.85 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.97 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  43.45 
 
 		 276 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  44.85 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  40.59 
 
 		 269 aa  185  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.96 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  47.23 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  43.12 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  46.5 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  40.22 
 
 		 270 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.76 
 
 		 274 aa  167  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  38.15 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  35.86 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  36.65 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  41.64 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  38.38 
 
 		 273 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  38.15 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  37.04 
 
 		 448 aa  148  8e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.33 
 
 		 445 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  38.43 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  36.53 
 
 		 449 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  38.02 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  40.74 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  41.64 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  35.79 
 
 		 275 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 		 443 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 		 443 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.7 
 
 		 443 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.67 
 
 		 446 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.23 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.25 
 
 		 276 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.2 
 
 		 445 aa  123  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.55 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  35.16 
 
 		 271 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  27.78 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  27.57 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.44 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.81 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  32.74 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.75 
 
 		 179 aa  65.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.15 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1802  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.26 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.145572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.94 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.9 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  24.39 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.08 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.08 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  32.85 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.07 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.19 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.19 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1102  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.41 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0221  ATP synthase F1, delta subunit  28.31 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.1203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.58 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2925  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.9 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.71 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  28.66 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.13 
 
 		 180 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.31 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.4 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44603  predicted protein  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1462  ATP synthase F1, delta subunit  29.34 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3944  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.48 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.754294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.87 
 
 		 182 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1641  ATP synthase F1, delta subunit  27.04 
 
 		 179 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0477  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.5 
 
 		 183 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199048  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  22.08 
 
 		 188 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4506  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4351  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.91 
 
 		 193 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  36.62 
 
 		 178 aa  53.1  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.06 
 
 		 180 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.87 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.48 
 
 		 179 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  29.34 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.24 
 
 		 178 aa  52.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.9 
 
 		 178 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.48 
 
 		 180 aa  52.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  28.42 
 
 		 180 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  30.52 
 
 		 209 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  25.6 
 
 		 177 aa  52.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4873  ATP synthase F1, delta subunit  38.46 
 
 		 176 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.97 
 
 		 177 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.19 
 
 		 179 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  29.69 
 
 		 178 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.3 
 
 		 179 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2937  ATP synthase delta chain  28.4 
 
 		 186 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.213023  normal  0.0695694 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  24.19 
 
 		 218 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  27.17 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.64 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  28.15 
 
 		 178 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.88 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4199  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  0.940305 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>