109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1313 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  100 
 
 		 275 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  50.18 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  48.34 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.29 
 
 		 271 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  39.51 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  38.27 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  38.78 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  37.19 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  38.71 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  37.96 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.41 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  33.82 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  36.59 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.95 
 
 		 443 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.98 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.5 
 
 		 445 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  35.34 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  37.35 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.05 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.4 
 
 		 445 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  33.09 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  37.12 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  32.79 
 
 		 449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.54 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  35.89 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  34.13 
 
 		 446 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  35.86 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  35.51 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  35.61 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  29.43 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.42 
 
 		 278 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  30.08 
 
 		 448 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  35.95 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08150  ATP synthase, F1 delta subunit  34.15 
 
 		 271 aa  90.5  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  28.05 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  32.74 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1798  ATP synthase F1, delta subunit  26.1 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.608577  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.67 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.43 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  34.12 
 
 		 179 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.67 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.4 
 
 		 182 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.01 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  23.38 
 
 		 182 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.3 
 
 		 178 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.3 
 
 		 178 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06107  ATP synthase F1, delta subunit  38.98 
 
 		 180 aa  52.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.82 
 
 		 178 aa  51.2  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  35 
 
 		 190 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  23.12 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.31 
 
 		 180 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2706  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.81 
 
 		 181 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000642797  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 		 180 aa  48.9  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.31 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  40.26 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 		 180 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  35.29 
 
 		 187 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.86 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.56 
 
 		 180 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2204  ATP synthase F1, delta subunit  32.89 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  23.31 
 
 		 192 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2296  ATPase, delta (OSCP) subunit  37.31 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0971  ATP synthase F1, delta subunit  37.31 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03055  ATP synthase subunit D  20.61 
 
 		 184 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.340236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2077  ATP synthase F1, delta subunit  32.47 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.589931  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3529  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.94 
 
 		 177 aa  47.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244392 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0509  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  32.81 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.78 
 
 		 182 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 		 180 aa  46.2  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.39 
 
 		 180 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.23 
 
 		 182 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.35 
 
 		 181 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.51 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.14 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1058  ATP synthase F1, delta subunit  27.08 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0600  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.98 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.82 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 		 182 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0533  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.83 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  26.71 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.25 
 
 		 180 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3655  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.79 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6065  ATP synthase F1, delta subunit  31.34 
 
 		 179 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  27.46 
 
 		 178 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  31.58 
 
 		 186 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.25 
 
 		 180 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0405  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.27 
 
 		 186 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.973166  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3409  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.57 
 
 		 180 aa  43.1  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0895663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2747  ATP synthase F1, delta subunit  30.67 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00491756  normal  0.287613 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0194  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.59 
 
 		 177 aa  43.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1316  ATP synthase F1, delta subunit  26 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.665716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0340  ATP synthase F1, delta subunit  33.85 
 
 		 188 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.55 
 
 		 178 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0988  H+transporting two-sector ATPase delta (OSCP) subunit  28.57 
 
 		 157 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.870325 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>