More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1918 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 449 aa  890    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  49 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.2 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.2 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.2 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.22 
 
 		 445 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2315  F0F1 ATP synthase subunit delta  42.44 
 
 		 445 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  41.91 
 
 		 446 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.19 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  38.21 
 
 		 275 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  39.92 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  36.29 
 
 		 276 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  34.62 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.45 
 
 		 269 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29580  ATP synthase, F1 delta subunit  33.84 
 
 		 273 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  35.51 
 
 		 274 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  32.7 
 
 		 269 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  34.32 
 
 		 275 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  32.95 
 
 		 274 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  32.79 
 
 		 275 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.22 
 
 		 274 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  33.58 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  36.53 
 
 		 271 aa  127  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  32.59 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.15 
 
 		 276 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  32.32 
 
 		 270 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 271 aa  113  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1069  ATP synthase F1, delta subunit  33.33 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  29.54 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  31.95 
 
 		 271 aa  109  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  30.99 
 
 		 275 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  31.18 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  29.27 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  31.82 
 
 		 275 aa  103  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.61 
 
 		 279 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  38.1 
 
 		 181 aa  96.7  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29590  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  37.97 
 
 		 182 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3634  ATP synthase F0, B subunit  39.19 
 
 		 175 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  32.7 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4016  ATP synthase F0, B subunit  36.77 
 
 		 179 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  34.18 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18240  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.67 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.539535  normal  0.298541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  30.97 
 
 		 181 aa  81.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.86 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  27.49 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1778  ATP synthase F0, B subunit  30.59 
 
 		 193 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3734  ATP synthase F0, B subunit  33.11 
 
 		 156 aa  73.2  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.23986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2342  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  32.35 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  24.67 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0896  ATP synthase F0 subunit B  28.21 
 
 		 181 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2609  ATP synthase F0, B subunit  31.87 
 
 		 182 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19170  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  29.68 
 
 		 179 aa  68.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1303  ATP synthase F0, B subunit  28.31 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6140  ATP synthase F0, B subunit  34.21 
 
 		 182 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  32.45 
 
 		 156 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.07 
 
 		 178 aa  67  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3711  F0F1 ATP synthase subunit B  31.14 
 
 		 196 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09990  ATP synthase F0 subcomplex B subunit  35.37 
 
 		 194 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.763368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1700  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  66.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1214  ATP synthase F0, B subunit  32.08 
 
 		 191 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3920  ATP synthase F0, B subunit  34.64 
 
 		 182 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  26.42 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0004  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000383011  hitchhiker  0.00333744 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2452  ATP synthase F0, B subunit  29.81 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  63.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3153  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.99 
 
 		 181 aa  62.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.87 
 
 		 179 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  27.38 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3134  F0F1 ATP synthase subunit delta  32.35 
 
 		 179 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2455  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 		 179 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  26.86 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  45.21 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.37 
 
 		 180 aa  61.6  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3215  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.32 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.270872  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4206  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000301032  normal  0.110777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1068  ATP synthase F0, B subunit  34.39 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4180  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000186765  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4222  F0F1 ATP synthase subunit B  29.8 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.29 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  30.46 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  30.57 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.12 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0649  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.123411  normal  0.231739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  28.17 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2882  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.91 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000839997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>